RasMol – полезная бесплатная программа для просмотра трехмерных структур – от простых молекул до белков и нуклеиновых кислот. Она может быть загружена, например, с сайта университета штата Массачусетс (www.umass.edu/microbio/rasmol) и входит в пакет ISIS / Draw.
Подобную программу 3D Viewer включено в пакет ChemSketch. Аналогичной программой визуализации молекулярной графики является Swiss PDB Viewer (www.expasy.ch/spdbv). Этот вьювер разработан в первую очередь для работы с трехмерными белковыми структурами, например, импортированными из базы Protein Data Bank.
Общеизвестны программы для работы с базами химических структур – ISIS / Base (MDL) и Chemfinder (Cambridge Soft) – являются дорогостоящими коммерческими продуктами, поэтому мы не будем останавливаться на них. К сожалению, похоже, что качественных бесплатных альтернатив нет.
Существуют и бесплатные программы по химической кинетике, кристаллографии, спектроскопии и др., которые мы не в состоянии осветить в этой публикации. Подборки программ, полезных для химиков-биооргаников, можно найти на многих сайтах. Так, большая коллекция бесплатных химических программ на все случаи жизни находится на сайте Tom’s Free Chemistry Software (www.users.ugent.be/~tkuppens/chem.shtml). Химические программы для Linux найдем на сайте Linux4Chemistry (www.redbrick.dcu.ie/~noel/linux4chemistry). Большинство из них является программами Open Source, бесплатными или бесплатными для использования в академических исследованиях.
В связи с ограниченным объемом публикации мы не могли остановиться на многих других ресурсах Интернета для химиков-биооргаников, связанных, например, с молекулярным моделированием и drug design, квантовой химией, базами химических реакций, химическими форумами и конференциями и др. Интернет настолько многогранен и масштабный, что охватить даже часть его ресурсов в небольшом обзоре крайне сложно. Поэтому призываем читателей искать нужные для них веб-ресурсы самостоятельно. Практически во всех случаях удается выявить ресурсы свободного доступа, многие из которых не уступают, а то и превышает своему уровню коммерческие аналоги.
(Окончание)